Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EPHA1P21709 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EPHA1P21709 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms