Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASTP20810 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASTP20810 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASTP20810 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASTP20810 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASTP20810 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASTP20810 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASTP20810 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASTP20810 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASTP20810 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASTP20810 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASTP20810 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASTP20810 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASTP20810 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASTP20810 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASTP20810 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASTP20810 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASTP20810 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASTP20810 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASTP20810 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CASTP20810 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CASTP20810 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASTP20810 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASTP20810 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASTP20810 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASTP20810 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASTP20810 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CASTP20810 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASTP20810 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASTP20810 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASTP20810 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASTP20810 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CASTP20810 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASTP20810 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASTP20810 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASTP20810 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms