Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B1P20020 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms