Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDCP19113 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDCP19113 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDCP19113 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDCP19113 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDCP19113 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDCP19113 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDCP19113 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDCP19113 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDCP19113 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms