Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGB6P18564 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms