Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRAP18433 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRAP18433 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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