Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPI1P17947 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPI1P17947 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPI1P17947 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPI1P17947 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPI1P17947 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPI1P17947 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPI1P17947 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPI1P17947 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPI1P17947 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SPI1P17947 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPI1P17947 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPI1P17947 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPI1P17947 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPI1P17947 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPI1P17947 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPI1P17947 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPI1P17947 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPI1P17947 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SPI1P17947 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPI1P17947 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms