Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA1P17302 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA1P17302 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA1P17302 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA1P17302 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA1P17302 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA1P17302 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA1P17302 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms