Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDGFRAP16234 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRAP16234 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms