Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD44P16070 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD44P16070 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD44P16070 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD44P16070 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD44P16070 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD44P16070 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD44P16070 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms