Protein–RNA interactions for Protein: P13712

MSI1, Chromatin assembly factor 1 subunit p50, yeastyeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSI1P13712 AI2Q0055 2565 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 SOK1YDR006C 2706 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 TIM11YDR322C-A 291 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 AFB1YLR040C 675 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 HRI1YLR301W 735 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 YLR302CYLR302C 363 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 MRPL44YMR225C 297 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 YNL122CYNL122C 348 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 YNR021WYNR021W 1215 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 YOL150CYOL150C 312 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 OST2YOR103C 393 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 PET123YOR158W 957 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 YPL034WYPL034W 498 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 SSF1YHR066W 1362 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 SEN54YPL083C 1404 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 YHR078WYHR078W 1659 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 MET6YER091C 2304 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 UTP14YML093W 2700 nt2.3□□□□□ -2.04
MSI1P13712 AXL1YPR122W 3627 nt2.29□□□□□ -2.04
MSI1P13712 YOL057WYOL057W 2136 nt2.29□□□□□ -2.04
MSI1P13712 SKT5YBL061C 2091 nt2.29□□□□□ -2.04
MSI1P13712 CWC22YGR278W 1734 nt2.29□□□□□ -2.04
MSI1P13712 MSB2YGR014W 3921 nt2.29□□□□□ -2.04
MSI1P13712 OTU2YHL013C 924 nt2.29□□□□□ -2.04
MSI1P13712 RPF1YHR088W 888 nt2.29□□□□□ -2.04
MSI1P13712 RPS22AYJL190C 393 nt2.29□□□□□ -2.04
MSI1P13712 FYV7YLR068W 456 nt2.29□□□□□ -2.04
MSI1P13712 HHT2YNL031C 411 nt2.29□□□□□ -2.04
MSI1P13712 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.29□□□□□ -2.04
MSI1P13712 FLO11YIR019C 4104 nt2.28□□□□□ -2.04
MSI1P13712 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.28□□□□□ -2.04
MSI1P13712 YGL015CYGL015C 393 nt2.28□□□□□ -2.04
MSI1P13712 SPO13YHR014W 876 nt2.28□□□□□ -2.04
MSI1P13712 SYS1YJL004C 612 nt2.28□□□□□ -2.04
MSI1P13712 VPS51YKR020W 495 nt2.28□□□□□ -2.04
MSI1P13712 YPL276WYPL276W 438 nt2.28□□□□□ -2.04
MSI1P13712 BI4Q0120 1917 nt2.28□□□□□ -2.04
MSI1P13712 SNF12YNR023W 1701 nt2.28□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YPL150WYPL150W 2706 nt2.27□□□□□ -2.05
MSI1P13712 FKS3YMR306W 5358 nt2.27□□□□□ -2.05
MSI1P13712 UBP15YMR304W 3693 nt2.27□□□□□ -2.05
MSI1P13712 BUB1YGR188C 3066 nt2.27□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.27□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YMR31YFR049W 372 nt2.27□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YGR045CYGR045C 363 nt2.27□□□□□ -2.05
MSI1P13712 RPL14BYHL001W 417 nt2.27□□□□□ -2.05
MSI1P13712 MRPL33YMR286W 261 nt2.27□□□□□ -2.05
MSI1P13712 AYT1YLL063C 1425 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 RGL1YPL066W 1440 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 DNA2YHR164C 4569 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 HNT1YDL125C 477 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YKL044WYKL044W 321 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 LSM2YBL026W 288 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 SWM2YNR004W 441 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 PEP12YOR036W 867 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 COG3YER157W 2406 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 SIP3YNL257C 3690 nt2.26□□□□□ -2.05
MSI1P13712 SSF2YDR312W 1362 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 NAB3YPL190C 2409 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YDR199WYDR199W 366 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YDR220CYDR220C 294 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 TIF35YDR429C 825 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 RPL9AYGL147C 576 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 FYV4YHR059W 393 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 SVS1YPL163C 783 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 ARR2YPR200C 393 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 TOR1YJR066W 7413 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 FUS1YCL027W 1539 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 CAF120YNL278W 3183 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 TCB2YNL087W 3537 nt2.25□□□□□ -2.05
MSI1P13712 SGS1YMR190C 4344 nt2.24□□□□□ -2.05
MSI1P13712 APC2YLR127C 2562 nt2.24□□□□□ -2.05
MSI1P13712 UBP16YPL072W 1500 nt2.24□□□□□ -2.05
MSI1P13712 SWR1YDR334W 4545 nt2.24□□□□□ -2.05
MSI1P13712 RVS161YCR009C 798 nt2.24□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.24□□□□□ -2.05
MSI1P13712 MXR1YER042W 555 nt2.24□□□□□ -2.05
MSI1P13712 RTS3YGR161C 792 nt2.24□□□□□ -2.05
MSI1P13712 ARV1YLR242C 966 nt2.24□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YHC1YLR298C 696 nt2.24□□□□□ -2.05
MSI1P13712 GPI15YNL038W 690 nt2.24□□□□□ -2.05
MSI1P13712 ESF2YNR054C 951 nt2.24□□□□□ -2.05
MSI1P13712 NPR1YNL183C 2373 nt2.23□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YBT1YLL048C 4986 nt2.23□□□□□ -2.05
MSI1P13712 TRM2YKR056W 1920 nt2.23□□□□□ -2.05
MSI1P13712 SPB1YCL054W 2526 nt2.23□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YPL216WYPL216W 3309 nt2.23□□□□□ -2.05
MSI1P13712 VAR1Q0140 1197 nt2.23□□□□□ -2.05
MSI1P13712 RPL16AYIL133C 600 nt2.23□□□□□ -2.05
MSI1P13712 TOA1YOR194C 861 nt2.23□□□□□ -2.05
MSI1P13712 RRG8YPR116W 834 nt2.23□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YCR001WYCR001W 315 nt2.22□□□□□ -2.05
MSI1P13712 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.22□□□□□ -2.05
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