Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA4P13612 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA4P13612 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms