Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIP12755 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIP12755 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIP12755 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIP12755 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIP12755 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKIP12755 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKIP12755 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKIP12755 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIP12755 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIP12755 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIP12755 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIP12755 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIP12755 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIP12755 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIP12755 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIP12755 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIP12755 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIP12755 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIP12755 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIP12755 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKIP12755 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIP12755 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIP12755 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIP12755 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIP12755 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIP12755 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIP12755 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIP12755 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIP12755 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIP12755 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIP12755 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SKIP12755 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms