Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A1P11836 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms