Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMC1P11047 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LAMC1P11047 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMC1P11047 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms