Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRFP10586 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRFP10586 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms