Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms