Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM228BP0C875 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms