Protein–RNA interactions for Protein: P08243

ASNS, Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing], humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASNSP08243 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASNSP08243 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASNSP08243 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASNSP08243 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASNSP08243 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASNSP08243 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASNSP08243 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASNSP08243 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASNSP08243 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASNSP08243 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASNSP08243 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASNSP08243 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASNSP08243 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASNSP08243 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASNSP08243 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASNSP08243 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASNSP08243 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASNSP08243 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASNSP08243 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASNSP08243 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASNSP08243 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASNSP08243 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASNSP08243 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASNSP08243 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASNSP08243 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASNSP08243 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASNSP08243 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASNSP08243 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASNSP08243 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASNSP08243 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms