Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDHBP07195 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDHBP07195 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LDHBP07195 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LDHBP07195 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LDHBP07195 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LDHBP07195 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LDHBP07195 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LDHBP07195 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LDHBP07195 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDHBP07195 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDHBP07195 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDHBP07195 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDHBP07195 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LDHBP07195 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDHBP07195 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LDHBP07195 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms