Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPM3P06753 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPM3P06753 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPM3P06753 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPM3P06753 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPM3P06753 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TPM3P06753 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TPM3P06753 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM3P06753 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms