Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPN1P04843 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN1P04843 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN1P04843 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN1P04843 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN1P04843 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN1P04843 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN1P04843 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPN1P04843 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPN1P04843 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN1P04843 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN1P04843 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN1P04843 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN1P04843 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN1P04843 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN1P04843 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN1P04843 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN1P04843 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN1P04843 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN1P04843 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN1P04843 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPN1P04843 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPN1P04843 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPN1P04843 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPN1P04843 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms