Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNAP02545 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNAP02545 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNAP02545 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNAP02545 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNAP02545 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMNAP02545 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNAP02545 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNAP02545 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNAP02545 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNAP02545 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNAP02545 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNAP02545 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNAP02545 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNAP02545 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMNAP02545 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMNAP02545 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMNAP02545 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMNAP02545 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNAP02545 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNAP02545 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNAP02545 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNAP02545 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNAP02545 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNAP02545 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNAP02545 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNAP02545 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNAP02545 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNAP02545 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LMNAP02545 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMNAP02545 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms