Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD4P01730 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD4P01730 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD4P01730 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD4P01730 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD4P01730 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD4P01730 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD4P01730 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD4P01730 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD4P01730 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD4P01730 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms