Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNB1P01574 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms