Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFRP00533 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFRP00533 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFRP00533 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFRP00533 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFRP00533 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFRP00533 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFRP00533 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFRP00533 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFRP00533 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFRP00533 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFRP00533 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EGFRP00533 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFRP00533 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFRP00533 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFRP00533 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFRP00533 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFRP00533 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFRP00533 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFRP00533 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFRP00533 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFRP00533 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFRP00533 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFRP00533 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EGFRP00533 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EGFRP00533 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EGFRP00533 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EGFRP00533 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EGFRP00533 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EGFRP00533 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EGFRP00533 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EGFRP00533 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFRP00533 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms