Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLR1AO95602 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLR1AO95602 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms