Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC24BO95487 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC24BO95487 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms