Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DCTN3O75935 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms