Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBBP9O75884 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms