Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP3O75154 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11FIP3O75154 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms