Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP9AO75110 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP9AO75110 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms