Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPLO60437 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PPLO60437 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PPLO60437 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPLO60437 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPLO60437 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPLO60437 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPLO60437 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPLO60437 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPLO60437 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PPLO60437 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPLO60437 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPLO60437 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPLO60437 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPLO60437 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPLO60437 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPLO60437 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPLO60437 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPLO60437 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPLO60437 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPLO60437 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPLO60437 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPLO60437 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPLO60437 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPLO60437 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPLO60437 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPLO60437 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPLO60437 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPLO60437 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPLO60437 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PPLO60437 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPLO60437 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPLO60437 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPLO60437 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms