Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXTL3O43909 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXTL3O43909 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms