Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LANCL1O43813 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LANCL1O43813 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms