Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1BO43795 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1BO43795 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms