Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPRY3O43610 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPRY3O43610 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPRY3O43610 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPRY3O43610 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms