Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPAA1O43292 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPAA1O43292 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms