Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DYNC1LI2O43237 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DYNC1LI2O43237 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms