Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD28O15084 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD28O15084 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms