Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A2O14975 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms