Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3AO14802 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms