Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APAF1O14727 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
APAF1O14727 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APAF1O14727 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
APAF1O14727 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APAF1O14727 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APAF1O14727 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APAF1O14727 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APAF1O14727 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APAF1O14727 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APAF1O14727 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APAF1O14727 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
APAF1O14727 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
APAF1O14727 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APAF1O14727 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APAF1O14727 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APAF1O14727 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APAF1O14727 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APAF1O14727 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APAF1O14727 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APAF1O14727 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APAF1O14727 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APAF1O14727 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APAF1O14727 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APAF1O14727 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
APAF1O14727 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APAF1O14727 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms