Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRTO14522 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRTO14522 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
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