Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms