Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEDD8-MDP1E9PL57 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEDD8-MDP1E9PL57 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms