Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E9PBE3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E9PBE3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E9PBE3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E9PBE3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E9PBE3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E9PBE3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E9PBE3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E9PBE3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E9PBE3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E9PBE3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E9PBE3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E9PBE3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E9PBE3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E9PBE3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
E9PBE3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E9PBE3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E9PBE3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
E9PBE3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E9PBE3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms