Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEURL1BA8MQ27 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEURL1BA8MQ27 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms