Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CYSRT1A8MQ03 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYSRT1A8MQ03 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms