Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TVP23AA6NH52 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TVP23AA6NH52 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TVP23AA6NH52 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TVP23AA6NH52 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TVP23AA6NH52 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TVP23AA6NH52 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TVP23AA6NH52 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TVP23AA6NH52 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TVP23AA6NH52 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TVP23AA6NH52 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TVP23AA6NH52 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TVP23AA6NH52 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms